Aycox

1.X收藏栏是按名称排序，你点击图中收藏栏最右边的三角，你说的没有看见的文件夹应该就在其中。

Aycox

楼主说重装系统还是不行，那么楼主应该是自定义的收藏夹位置，的确未见过此情况，我想如下可能：
1、收藏夹与收藏栏的自定义位置不同，这个可能性只是提出来，如果楼主十分确认两者自定义的路径是相同的，那么此条忽略。
2、删除收藏夹下的隐藏文件Favorder.db（注意2.0的是Favsorder.db，如果此收藏夹没有与2.0共用也可都删除），这样收藏夹当前目录的排序数据将被清除，再看看情况。